Dengan berbagai tantangan dan peluang yang ada, masa depan PSN PIK 2 masih menjadi perdebatan. Pemerintah, dalam hal ini Presiden Prabowo Subianto, sedang mengkaji ulang proyek ini dalam konteks kebijakan PSN yang lebih terarah. Ada empat kategori PSN yang menjadi prioritas di era pemerintahan Prabowo, yakni proyek yang mendukung swasembada pangan, swasembada energi, hilirisasi industri, serta proyek perlindungan infrastruktur strategis seperti giant sea wall untuk mengamankan Jakarta dari ancaman banjir.
Pertanyaan yang muncul adalah apakah PSN PIK 2 akan masuk ke dalam salah satu kategori tersebut atau justru akan dievaluasi ulang untuk menyesuaikan dengan kebijakan pembangunan nasional yang lebih berkelanjutan. Pada akhirnya, proyek PSN PIK 2 mencerminkan tarik ulur antara kepentingan pembangunan, ekonomi dan keberlanjutan lingkungan.