Dengan segala tantangan pada tahun tersebut karena adanya stigma “Wanita Tidak Pantas Menjadi Dokter”, Ainun membuktikan bahwa ia pantas menjadi dokter dengan predikat sebagai Lulusan Terbaik. Rudy pun sempat mengalami perdebatan dengan teman-teman di kampusnya yang meragukan kecerdasanya. Keduanya masing-masing sempat memiliki hubungan dengan orang lain, tetapi takdir berkata lain hubungan tersebut kandas.
Pada suatu hari, Rudy datang ke rumah Ainun dan pada saat itulah mulai tumbuh kembali perasaan mereka berdua dan mereka berduapun menjadi pasangan kekasih. Singkat cerita keduanya akhirnya memilih untuk menikah dan tinggal di Jerman.
Ternyata Rudy Habibie memiliki riwayat penyakit TBC Tulang saat ia berkuliah di Jerman. Namun, Ainun tetap setia merawat, mengingatkan minum obat, serta mendukung segala yang dilakukan Habibie. Lambat laun Kondisi Ainun pun menurun ketika ia sudah menjadi Ibu Negara, ternyata ia didiagnosis Kanker Ovarium.
